Kursplan

Introduksjon til programmeringsspråket Python

  • Hvorfor Python?
  • Bruke Python for å håndtere biologiske data
  • Arbeid med iPython-skallet
  • Ditt første program
  • Skrive Python manus
  • Importerer moduler

Arbeid med protein og RNA/DNA-sekvenser

  • Finne motiver
  • Transkripsjon og oversettelse i silico
  • Håndtering av sekvensjusteringer

Parsing av data i ulike biologiske formater

  • Parsing FASTA
  • Dataformatkonverteringer

Kjører biologiske analyser

  • BLAST
  • Accessing av biologiske nettjenester

Håndtere biologiske 3D-strukturer ved hjelp av Python

Python forenkler statistisk analyse

Visualisere data

  • Opprette bar- og spredningsplott
  • Beregne et område under kurve (AUC)

Arbeide med .xls- og .csv-filer

  • Importere data fra og eksportere til MS Excel / OpenOffice Calc
  • Skrive .xls- og .csv-filer

Bruke Python for å lage en automatisert databehandlingspipeline

Krav

Grunnleggende biologisk kunnskap om protein, RNA og DNA-sekvenser.

 28 timer

Antall deltakere


Price per participant

Testimonials (1)

Upcoming Courses

Related Categories